饲养室内的温度保持在22－28℃，相对湿度维持在40％－60％，饲养盒内温度一般比外界环境高1～2℃，湿度高5～10％。昼夜明暗交替时间为12/12；噪音＜60dB, ；氨浓度不超过20ppm，换气次数应达到10～20次/小时；饲养室内每天经紫外灯照射两小时杀菌，定期用消毒水进行清洁消毒。

饲料：采用60Coγ射线灭菌的无菌全价营养颗粒料，并可定时喂少量葵花籽。成年转基因鼠采食量一般为3～7克/天，转基因幼鼠一般为1～3克/天，应每周添料3～4次，在鼠笼的料斗内应经常有足够量的新鲜干燥饲料，在转基因小鼠大群饲养中，每周应固定两天添加饲料，其它时间可根据情况随时注意添加。

饮用水：为纯净水装瓶后高压灭菌，每周换水2～3次，成年鼠饮水量一般为4～7ml/天，要保证饮水的连续不断，应常检查瓶塞，防止瓶塞漏水造成动物溺死或饮水管堵塞使小鼠脱水死亡。

垫料：使用经高压灭菌的混合木屑或者玉米芯；鼠笼采用M5型小鼠饲养笼，高压灭菌。鼠笼和垫料每周更换两次。各种操作均在超净工作台内按照无菌操作进行。

日常登记和观察:每天登记各环境数据和小鼠状况，密切观察小鼠饮食、活动及全身情况，若有发现异常状况时需登记检查原因。外观判断小鼠健康的标准是：
①食欲旺盛；
②眼睛有神，反应敏捷；
③体毛光滑，肌肉丰满，活动有力；
④身无伤痕，尾不弯曲，天然孔腔无分泌物，无畸形；
⑤粪便黑色呈麦粒状

即将产崽或刚产崽的的转基因鼠尽量不去打扰，以免刺激到母鼠，可提前加足水和饲料；产崽前可在笼盒内添加一定量的棉絮供其筑窝用。

对于即将运用于实验的转基因小鼠，如无特殊体质缺陷（如营养缺陷型，免疫缺陷型等），可适用普通小鼠的饲养标准。